تتطلع إدارة المعهد إلى تحقيق رسالة وأهداف مؤسسة الإرث النبوي للتنمية،كما تطمح إلى إعداد خريج متوازن الشخصية ومؤهلا علميا ودعويا وسلوكيا يساهم في نفع الأمة، من خلال فتح جميع المراحل الدراسية ابتداء من المرحلة التمهيدية ثم الابتدائية ثم الإعدادية، ثم الثانوية؛ ووصولا إلى مرحلة التخصص الشرعي والرسوخ في العلوم الشرعية والعربية، إسهاما في سد حاجة المجتمعات من مرجعيات العلماء الراسخين، والفقهاء المفتين،  والمدرسين المربين، والدعاة المصلحين.